获得饮用水是难民安置区所面临的最大挑战之一。无国界医生使用水泵从尼罗河取水，然后进行净化处理。净化后的水再经由联合国难民署租用的水车运送至所有难民安置区。无国界医生团队一直努力扩大对安置区难民水供给的规模： 仅在帕洛林亚（Palorinya）难民安置区，无国界医生团队就每天净化200万升水，向超过10万人提供支持。
